生產過程中，種子質量受各種因素的影響，如培養基、PH值、種齡、接種量、培養溫度和濕度等。種子異常時有發生，給發酵生產造成極大影響。種子異常往往表現為：（1）菌種生長發育緩慢或過快菌種在種子罐生長發育緩慢或過快，和孢子質量以及種子罐的培養條件有關。生產過程中，通入種子罐的無菌空氣溫度較低或培養基的滅菌質量較差是種子生長、代謝緩慢的主要原因。（2）菌絲結團在液體培養條件下，繁殖的菌絲并不分散舒展而聚成團狀稱為菌絲團。此時，從培養液的外觀能看見白色的小顆粒，菌絲聚集成團會影響菌的呼吸和對營養物質的吸收。如果種子液中的菌絲團較少，進入發酵罐后，在良好的培養條件下，可以逐漸消失，不會對發酵生產產生明顯影響。但如果菌絲團較多，種子液移入發酵罐后往往形成更多的菌絲團，影響發酵的正常進行。菌絲結團與攪拌效果差、接種量小有關。一個菌絲團可由一個孢子生長發育而來，也可由多個菌絲體聚集一起逐漸形成。（3）菌絲粘壁菌絲粘壁是指在種子培養過程中，由于攪拌效果不好，泡沫過多以及種子罐裝料系數過小等原因，使菌絲逐步粘在罐壁上。其結果使培養液中菌絲濃度減少，最后就可能形成菌絲團。在真菌進行的發酵生產中，發生菌絲粘壁的機會較多。本文參考《發酵工程原理與技術》一書。